Die Thargoiden sind eine nicht-menschliche Spezies, die auf eine konfliktreiche Geschichte mit der Menschheit zurückblickt.
Die erste Aufzeichnung über die Sichtung eines Thargoidenschiffs stammt aus dem Jahr 2849, obwohl man davon ausgeht, dass es schon vorher derartige Begegnungen gab. In den folgenden Jahren gab es in unregelmäßigen Abständen immer wieder Berichte über Kontakte mit einzelnen Thargoidenschiffen.
Zum offenen Konflikt zwischen Menschen und Thargoiden kam es erst im 32. Jahrhundert. Details zu diesem Schlagabtausch gab es Jedoch kaum, und es stellte sich als schwierig heraus, authentische Aufzeichnungen von den sensationslüsternen Geschichten der damaligen Medien zu unterscheiden.
Erst die Entdeckung der Basis der Intergalactic Naval Reserve Arm im Jahr 3303 trug erheblich dazu bei, den Nebel zu lichten. Die INRA, eine gemeinsame Initiative von Föderation und Imperium, wurde im Jahr 3193 ins Leben gerufen. Sie sollte die Thargoiden erforschen und Technologien zu ihrer Bekämpfung entwickeln. Da die Organisation niemandem zur Rechenschaft verpflichtet war, blieben die Details ihrer Arbeit weitgehend ein Geheimnis, vieles davon kam erst Jahre nach ihrer Auflösung ans Licht.
Nahezu alle belastbaren Informationen über die Thargoiden stammen von den Anlagen der INRA. Die ursprünglich streng vertraulichen Daten wurden auf Anordnung der föderalen Regierung und des Imperiums erst im Jahr 3304 freigegeben. Wer genau letztlich hinter der INRA stand und wer sie finanzierte, bleibt bis heute Jedoch ungeklärt.